Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
FOXO1Q12778 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms