Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AP1B1Q10567 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms