Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms