Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SCN1BQ07699 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms