Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms