Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms