Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms