Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLTCQ00610 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms