Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIM1P81133 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIM1P81133 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIM1P81133 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms