Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN8P56748 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN8P56748 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN8P56748 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN8P56748 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN8P56748 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN8P56748 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN8P56748 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN8P56748 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN8P56748 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN8P56748 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN8P56748 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN8P56748 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN8P56748 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN8P56748 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms