Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBP50607 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBP50607 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBP50607 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBP50607 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBP50607 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBP50607 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBP50607 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBP50607 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBP50607 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBP50607 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBP50607 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBP50607 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBP50607 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBP50607 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBP50607 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBP50607 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBP50607 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBP50607 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBP50607 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBP50607 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBP50607 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBP50607 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBP50607 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBP50607 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBP50607 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TUBP50607 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TUBP50607 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TUBP50607 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TUBP50607 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TUBP50607 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TUBP50607 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TUBP50607 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBP50607 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBP50607 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBP50607 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBP50607 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBP50607 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBP50607 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBP50607 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBP50607 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBP50607 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBP50607 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBP50607 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBP50607 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms