Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms