Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSOP43234 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSOP43234 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSOP43234 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSOP43234 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSOP43234 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSOP43234 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSOP43234 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSOP43234 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSOP43234 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSOP43234 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSOP43234 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSOP43234 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSOP43234 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSOP43234 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms