Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR1BP42025 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms