Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHRNA7P36544 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms