Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXD13P35453 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms