Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CTNNB1P35222 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNB1P35222 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms