Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTGER1P34995 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms