Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB5P28074 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms