Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5A1P25705 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP5A1P25705 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5A1P25705 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5A1P25705 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5A1P25705 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5A1P25705 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5A1P25705 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5A1P25705 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5A1P25705 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5A1P25705 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5A1P25705 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5A1P25705 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5A1P25705 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5A1P25705 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5A1P25705 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP5A1P25705 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5A1P25705 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5A1P25705 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5A1P25705 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5A1P25705 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms