Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKCHP24723 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms