Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XPAP23025 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XPAP23025 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XPAP23025 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XPAP23025 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XPAP23025 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XPAP23025 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XPAP23025 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XPAP23025 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XPAP23025 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XPAP23025 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XPAP23025 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XPAP23025 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XPAP23025 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XPAP23025 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XPAP23025 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XPAP23025 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms