Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
USF1P22415 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF1P22415 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USF1P22415 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USF1P22415 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USF1P22415 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
USF1P22415 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USF1P22415 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USF1P22415 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USF1P22415 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USF1P22415 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
USF1P22415 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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