Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM21P19474 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM21P19474 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms