Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2CP19387 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms