Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCP1P17987 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCP1P17987 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCP1P17987 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCP1P17987 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCP1P17987 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCP1P17987 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TCP1P17987 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCP1P17987 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TCP1P17987 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TCP1P17987 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TCP1P17987 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TCP1P17987 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TCP1P17987 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TCP1P17987 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TCP1P17987 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCP1P17987 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCP1P17987 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCP1P17987 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCP1P17987 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCP1P17987 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCP1P17987 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCP1P17987 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCP1P17987 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCP1P17987 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TCP1P17987 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms