Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHGAP10645 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHGAP10645 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHGAP10645 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHGAP10645 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHGAP10645 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHGAP10645 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHGAP10645 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHGAP10645 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHGAP10645 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHGAP10645 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHGAP10645 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHGAP10645 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHGAP10645 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHGAP10645 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHGAP10645 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHGAP10645 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHGAP10645 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHGAP10645 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHGAP10645 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHGAP10645 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHGAP10645 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHGAP10645 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHGAP10645 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHGAP10645 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHGAP10645 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHGAP10645 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHGAP10645 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHGAP10645 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHGAP10645 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHGAP10645 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHGAP10645 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHGAP10645 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHGAP10645 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHGAP10645 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHGAP10645 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHGAP10645 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHGAP10645 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHGAP10645 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHGAP10645 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHGAP10645 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHGAP10645 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHGAP10645 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHGAP10645 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHGAP10645 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHGAP10645 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHGAP10645 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHGAP10645 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHGAP10645 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHGAP10645 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHGAP10645 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHGAP10645 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHGAP10645 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHGAP10645 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHGAP10645 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHGAP10645 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHGAP10645 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHGAP10645 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHGAP10645 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHGAP10645 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHGAP10645 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHGAP10645 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHGAP10645 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHGAP10645 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHGAP10645 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHGAP10645 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHGAP10645 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHGAP10645 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHGAP10645 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHGAP10645 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHGAP10645 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHGAP10645 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHGAP10645 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHGAP10645 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHGAP10645 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHGAP10645 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHGAP10645 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHGAP10645 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHGAP10645 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHGAP10645 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHGAP10645 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHGAP10645 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHGAP10645 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHGAP10645 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHGAP10645 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHGAP10645 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHGAP10645 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHGAP10645 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHGAP10645 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHGAP10645 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHGAP10645 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHGAP10645 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHGAP10645 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHGAP10645 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHGAP10645 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHGAP10645 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms