Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM10L2BP0DMW5 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms