Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00032P0C843 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00032P0C843 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms