Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX3O95343 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX3O95343 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX3O95343 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX3O95343 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX3O95343 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX3O95343 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX3O95343 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIX3O95343 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SIX3O95343 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIX3O95343 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX3O95343 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX3O95343 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX3O95343 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX3O95343 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX3O95343 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SIX3O95343 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX3O95343 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX3O95343 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SIX3O95343 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX3O95343 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SIX3O95343 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX3O95343 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX3O95343 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SIX3O95343 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX3O95343 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SIX3O95343 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX3O95343 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX3O95343 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX3O95343 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX3O95343 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX3O95343 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX3O95343 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX3O95343 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX3O95343 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX3O95343 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX3O95343 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX3O95343 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX3O95343 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX3O95343 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIX3O95343 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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