Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COCHO43405 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COCHO43405 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COCHO43405 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms