Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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HOXA3O43365 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HOXA3O43365 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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