Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 RABGEF1-209ENST00000607882 2654 ntTSL 212.49□□□□□ -0.415e-6■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 TNFRSF14-203ENST00000426449 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.46□□□□□ -0.411e-7■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 LTBP4-216ENST00000597071 670 ntTSL 212.42□□□□□ -0.425e-6■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 ACAD11-207ENST00000489991 574 ntTSL 412.25□□□□□ -0.451e-7■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 SNHG12-205ENST00000470977 1098 ntTSL 1 (best)12.19□□□□□ -0.461e-7■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 TNFRSF14-208ENST00000463471 4255 ntTSL 211.89□□□□□ -0.511e-7■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 ACAD11-201ENST00000264990 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.571e-7■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 ARRB1-212ENST00000533609 559 ntTSL 511.44□□□□□ -0.581e-7■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 RABGEF1-208ENST00000510829 3553 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.585e-6■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 ACAD11-202ENST00000469042 3276 ntTSL 211.39□□□□□ -0.591e-7■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 MARF1-205ENST00000548025 5891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.595e-6■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 ACAD11-205ENST00000485198 2940 ntTSL 1 (best)11.3□□□□□ -0.61e-7■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 CCDC144NL-AS1-214ENST00000581958 1188 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.755e-6■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 GRAMD1A-209ENST00000598580 400 ntTSL 310.39□□□□□ -0.755e-6■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 RABGEF1-205ENST00000450873 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.795e-6■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 SNHG12-211ENST00000488745 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.81e-7■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 MARF1-202ENST00000540441 7105 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.835e-6■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 HDAC6-222ENST00000478095 620 ntTSL 49.73□□□□□ -0.855e-6■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 MARF1-211ENST00000551742 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.885e-6■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 RABGEF1-201ENST00000284957 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.95e-6■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 CCDC144NL-AS1-217ENST00000583481 710 ntTSL 39.21□□□□□ -0.945e-6■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 SH3BP4-207ENST00000454947 500 ntTSL 49.16□□□□□ -0.945e-6■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 MARF1-201ENST00000396368 7743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.025e-6■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 CCDC144NL-AS1-202ENST00000423473 839 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.035e-6■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.035e-6■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 SPATS2L-213ENST00000438761 887 ntTSL 58.03□□□□□ -1.125e-6■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 OGT-204ENST00000455587 632 ntTSL 37.97□□□□□ -1.132e-11■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 SPATS2L-217ENST00000449647 678 ntTSL 56.8□□□□□ -1.325e-6■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 AHSA2-206ENST00000484217 1741 ntTSL 56.54□□□□□ -1.361e-7■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 AHSA2-211ENST00000493628 633 ntTSL 36.43□□□□□ -1.381e-7■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 CTTN-207ENST00000483662 736 ntTSL 26.28□□□□□ -1.49e-13■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.471e-7■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 AHSA2-207ENST00000487904 505 ntTSL 34.04□□□□□ -1.761e-7■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 SPATS2L-203ENST00000366118 695 ntTSL 33.77□□□□□ -1.815e-6■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 AHSA2-209ENST00000491217 423 ntTSL 33.66□□□□□ -1.821e-7■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 NPHP3-ACAD11-202ENST00000632629 695 ntAPPRIS P1 TSL 23.36□□□□□ -1.871e-7■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 CNOT6-206ENST00000510148 456 ntTSL 423.62■■□□□ 1.377e-10■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 CNOT6-205ENST00000507016 382 ntTSL 322.27■■□□□ 1.167e-10■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.777e-10■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.617e-10■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.427e-10■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.362e-7■□□□□ 8
PRPF4O43172 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.362e-7■□□□□ 8
PRPF4O43172 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.992e-7■□□□□ 8
PRPF4O43172 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.862e-7■□□□□ 8
PRPF4O43172 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.812e-7■□□□□ 8
PRPF4O43172 PCMT1-209ENST00000494411 600 ntTSL 418.14■□□□□ 0.492e-7■□□□□ 8
PRPF4O43172 PCMT1-207ENST00000484601 1095 ntTSL 517.14■□□□□ 0.332e-7■□□□□ 8
PRPF4O43172 PCMT1-204ENST00000460828 582 ntTSL 516.07■□□□□ 0.162e-7■□□□□ 8
PRPF4O43172 PCMT1-210ENST00000495487 548 ntTSL 314.47□□□□□ -0.092e-7■□□□□ 8
PRPF4O43172 PCMT1-208ENST00000486585 801 ntTSL 39.41□□□□□ -0.92e-7■□□□□ 8
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