Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBDO15205 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBDO15205 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms