Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TO15178 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TO15178 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms