Protein–RNA interactions for Protein: F8W031

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W031 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
F8W031 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
F8W031 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
F8W031 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms