Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP17L12C9JPN9 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms