Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLDN25C9JDP6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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