Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS37CA5D8V6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms