Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HECTD4Q9Y4D8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms