Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HDGFL3Q9Y3E1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms