Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SATB2Q9UPW6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms