Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS4AQ9UN37 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms