Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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