Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms