Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNK4Q9NYG8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms