Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG7

SDR39U1, Epimerase family protein SDR39U1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR39U1Q9NRG7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDR39U1Q9NRG7 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDR39U1Q9NRG7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms