Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F12Q9HCS2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms