Protein–RNA interactions for Protein: Q9C040

TRIM2, Tripartite motif-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM2Q9C040 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM2Q9C040 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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