Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYM8

RBCK1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBCK1Q9BYM8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBCK1Q9BYM8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms